Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ebi3O35228 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms