Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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RrhO35214 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RrhO35214 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RrhO35214 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RrhO35214 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RrhO35214 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RrhO35214 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RrhO35214 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RrhO35214 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RrhO35214 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RrhO35214 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms