Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Polr1aO35134 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Polr1aO35134 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms