Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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