Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Cldn4O35054 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms