Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq1O09165 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq1O09165 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq1O09165 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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