Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Degs1O09005 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Degs1O09005 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Degs1O09005 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Degs1O09005 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Degs1O09005 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Degs1O09005 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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