Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncoa3O09000 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms