Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms