Protein–RNA interactions for Protein: L7N2F1

Vmn1r31, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r31L7N2F1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r31L7N2F1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r31L7N2F1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r31L7N2F1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms