Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnabL7MTU6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms