Protein–RNA interactions for Protein: K7N6B6

Vmn1r168, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r168K7N6B6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms