Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms