Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20918J3QN17 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms