Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp870J3QMA4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp870J3QMA4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp870J3QMA4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp870J3QMA4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zfp870J3QMA4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Zfp870J3QMA4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Zfp870J3QMA4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Zfp870J3QMA4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zfp870J3QMA4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zfp870J3QMA4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zfp870J3QMA4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp870J3QMA4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zfp870J3QMA4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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