Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms