Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21060J3KMU4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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