Protein–RNA interactions for Protein: J3KMT3

Gm6882, Predicted gene 6882, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6882J3KMT3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6882J3KMT3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6882J3KMT3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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