Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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