Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms