Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms