Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms