Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SprtnG3X912 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SprtnG3X912 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms