Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms