Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim55G3X8Y1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms