Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Speer4cG3UXD1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms