Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl26F8VQM2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl26F8VQM2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms