Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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