Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms