Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Arid4aF8VPQ2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arid4aF8VPQ2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms