Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms