Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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