Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D430041D05RikF6ZGR6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms