Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8444F6XS56 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms