Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms