Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms