Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms