Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN3

Gm1979, Predicted gene 1979, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1979E9QAN3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1979E9QAN3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1979E9QAN3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1979E9QAN3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1979E9QAN3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1979E9QAN3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1979E9QAN3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1979E9QAN3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1979E9QAN3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm1979E9QAN3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm1979E9QAN3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm1979E9QAN3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms