Protein–RNA interactions for Protein: E9QAE1

Nckap5, NCK-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5E9QAE1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap5E9QAE1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms