Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms