Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms