Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms