Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms