Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Urb2E9Q7L1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms