Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6I0

Vmn2r116, Vomeronasal type-2 receptor 116, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r116E9Q6I0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r116E9Q6I0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms