Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D3

Ccdc121, Coiled-coil domain-containing 121, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc121E9Q6D3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc121E9Q6D3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc121E9Q6D3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms