Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms