Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r56E9Q4U5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r56E9Q4U5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms