Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3893E9Q1I1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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