Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms